Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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