Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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DNASE1L3Q13609 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DNASE1L3Q13609 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DNASE1L3Q13609 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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