Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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