Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 HPA3YEL066W 540 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YHL005CYHL005C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YKL111CYKL111C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YOR146WYOR146W 306 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 NSL1YPL233W 651 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 MDM1YML104C 3384 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 RSN1YMR266W 2862 nt2.67□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 TFC4YGR047C 3078 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 BNA4YBL098W 1383 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDL068WYDL068W 330 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 RPL6AYML073C 531 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 RPL19BYBL027W 570 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YLR278CYLR278C 4026 nt2.66□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YER138CYER138C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YER160CYER160C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YJR027WYJR027W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YML039WYML039W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YML045WYML045W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YMR050CYMR050C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
RRI1Q12468 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.65□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YIL054WYIL054W 318 nt2.65□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YKL118WYKL118W 312 nt2.65□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 GCD10YNL062C 1437 nt2.65□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 MET5YJR137C 4329 nt2.65□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 CYR1YJL005W 6081 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 TWF1YGR080W 999 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 FYV4YHR059W 393 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 VTI1YMR197C 654 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 PEP12YOR036W 867 nt2.64□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 ESL1YIL151C 3357 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 SNX41YDR425W 1878 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 APC11YDL008W 498 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 TIM8YJR135W-A 264 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 JIP3YLR331C 378 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YNL043CYNL043C 321 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 PSY2YNL201C 2577 nt2.63□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 RGR1YLR071C 3249 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 MAM33YIL070C 801 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YNL034WYNL034W 1839 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YSW1YBR148W 1830 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 RAX2YLR084C 3663 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 SIP3YNL257C 3690 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YOR296WYOR296W 3870 nt2.62□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YJR003CYJR003C 1560 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 CDC20YGL116W 1833 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 GPI8YDR331W 1236 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YAF9YNL107W 681 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YBL108WYBL108W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 SEC7YDR170C 6030 nt2.61□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 NPR1YNL183C 2373 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 NET1YJL076W 3570 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 NDD1YOR372C 1665 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YDL152WYDL152W 366 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 NHP2YDL208W 471 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YHL037CYHL037C 402 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 BAT1YHR208W 1182 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 EGD1YPL037C 474 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 ECM29YHL030W 5607 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 NMD2YHR077C 3270 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YCL019WYCL019W 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 DBP10YDL031W 2988 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YMR31YFR049W 372 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 PNC1YGL037C 651 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YGR107WYGR107W 450 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 RPS22BYLR367W 393 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YPL238CYPL238C 390 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YPR203WYPR203W 309 nt2.59□□□□□ -1.99
RRI1Q12468 YIL169CYIL169C 2988 nt2.59□□□□□ -2
RRI1Q12468 SSY1YDR160W 2559 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 COG3YER157W 2406 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.9 ms