Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNA1Q09470 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA1Q09470 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms