Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PUDPQ08623 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms