Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms