Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACVR1Q04771 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACVR1Q04771 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms