Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 YOR385WYOR385W 873 nt2.97□□□□□ -1.93
SND1Q04007 SLM6YBR266C 453 nt2.97□□□□□ -1.93
SND1Q04007 PPN1YDR452W 2025 nt2.97□□□□□ -1.93
SND1Q04007 JIP5YPR169W 1479 nt2.96□□□□□ -1.93
SND1Q04007 SKP2YNL311C 2292 nt2.96□□□□□ -1.93
SND1Q04007 SEC7YDR170C 6030 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 GPI14YJR013W 1212 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RAM2YKL019W 951 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 VPH2YKL119C 648 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 AIM32YML050W 936 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 MSB2YGR014W 3921 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 PES4YFR023W 1836 nt2.96□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YKR078WYKR078W 1758 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 IES5YER092W 378 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 COX14YML129C 213 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RPL36AYMR194W 303 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YPR203WYPR203W 309 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 TFC4YGR047C 3078 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 TCB2YNL087W 3537 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 ESL1YIL151C 3357 nt2.95□□□□□ -1.94
SND1Q04007 HRD3YLR207W 2502 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YDR269CYDR269C 324 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 GET1YGL020C 708 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YKL111CYKL111C 336 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YAR047CYAR047C 321 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 SIP18YMR175W 240 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YNL058CYNL058C 951 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RPS12YOR369C 432 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RPL33AYPL143W 324 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 INP53YOR109W 3324 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 TUS1YLR425W 3924 nt2.94□□□□□ -1.94
SND1Q04007 MUD2YKL074C 1584 nt2.93□□□□□ -1.94
SND1Q04007 DYN2YDR424C 279 nt2.93□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YBL071CYBL071C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YOR029WYOR029W 336 nt2.93□□□□□ -1.94
SND1Q04007 SNU114YKL173W 3027 nt2.93□□□□□ -1.94
SND1Q04007 ASG1YIL130W 2895 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 ISW1YBR245C 3390 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YDR250CYDR250C 276 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YER079WYER079W 633 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 AAD16YFL057C 459 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 ERP6YGL002W 651 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YJR079WYJR079W 330 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 PHD1YKL043W 1101 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 AIM29YKR074W 468 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 ICY1YMR195W 384 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YBR012CYBR012C 420 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 AMS1YGL156W 3252 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YGR067CYGR067C 2415 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 AYT1YLL063C 1425 nt2.92□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RLI1YDR091C 1827 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 TRS130YMR218C 3309 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 RRF1YHR038W 693 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 TIF11YMR260C 462 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YOR248WYOR248W 303 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 MSS18YPR134W 807 nt2.91□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YPK1YKL126W 2043 nt2.9□□□□□ -1.94
SND1Q04007 YBT1YLL048C 4986 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YDL068WYDL068W 330 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 TIM8YJR135W-A 264 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YKR033CYKR033C 426 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YAR068WYAR068W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RPS7BYNL096C 573 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RPL25YOL127W 429 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RIF1YBR275C 5751 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 INP51YIL002C 2841 nt2.9□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YCR064CYCR064C 411 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 SDC1YDR469W 528 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YFR056CYFR056C 369 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YGL165CYGL165C 579 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YHR138CYHR138C 345 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RPL40AYIL148W 387 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YJR011CYJR011C 786 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RPS29AYLR388W 171 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YOL159CYOL159C 516 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 PTC5YOR090C 1719 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 HOS4YIL112W 3252 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YJL070CYJL070C 2667 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 VPS16YPL045W 2397 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 SKT5YBL061C 2091 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YEL043WYEL043W 2871 nt2.89□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RNH70YGR276C 1662 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 ATG31YDR022C 591 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YGR050CYGR050C 357 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YML003WYML003W 873 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YML084WYML084W 309 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 PEX17YNL214W 600 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 MOT1YPL082C 5604 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 TOP2YNL088W 4287 nt2.88□□□□□ -1.95
SND1Q04007 ACB1YGR037C 264 nt2.87□□□□□ -1.95
SND1Q04007 NBL1YHR199C-A 222 nt2.87□□□□□ -1.95
SND1Q04007 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.87□□□□□ -1.95
SND1Q04007 YLR101CYLR101C 396 nt2.87□□□□□ -1.95
SND1Q04007 RPS1AYLR441C 768 nt2.87□□□□□ -1.95
SND1Q04007 MRPL33YMR286W 261 nt2.87□□□□□ -1.95
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