Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 TSC11YER093C 4293 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 NTO1YPR031W 2247 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 FAR1YJL157C 2493 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 RMT2YDR465C 1239 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 SDC1YDR469W 528 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 RPL30YGL030W 318 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YGR107WYGR107W 450 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YKL083WYKL083W 615 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 snR42snR42 351 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YEL025CYEL025C 3567 nt3.58□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 ECM5YMR176W 4236 nt3.57□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 GPI8YDR331W 1236 nt3.57□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YIL054WYIL054W 318 nt3.57□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 GCN1YGL195W 8019 nt3.57□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 AI2Q0055 2565 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YDL152WYDL152W 366 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 LCL2YLR104W 396 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 DUF1YOL087C 3351 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 CIN8YEL061C 3003 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 RLF2YPR018W 1821 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 BMS1YPL217C 3552 nt3.56□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 STE6YKL209C 3873 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 CAJ1YER048C 1176 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 URM1YIL008W 300 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 ATP3YBR039W 936 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 RCY1YJL204C 2523 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 SPO71YDR104C 3738 nt3.55□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 ECM25YJL201W 1800 nt3.54□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YOL057WYOL057W 2136 nt3.54□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 BIL1YOR304C-A 231 nt3.54□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 SOK1YDR006C 2706 nt3.54□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 APC2YLR127C 2562 nt3.54□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 BNA4YBL098W 1383 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YJL016WYJL016W 1686 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YDR250CYDR250C 276 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 RPS22BYLR367W 393 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 YAF9YNL107W 681 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 POL3YDL102W 3294 nt3.53□□□□□ -1.84
GDE1Q02979 BRO1YPL084W 2535 nt3.52□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 SPB1YCL054W 2526 nt3.52□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 MET5YJR137C 4329 nt3.52□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YPK1YKL126W 2043 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YDR413CYDR413C 576 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YER097WYER097W 330 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 TPS2YDR074W 2691 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 COX1Q0045 1605 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YIL166CYIL166C 1629 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 GYP7YDL234C 2241 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 VTC4YJL012C 2166 nt3.51□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 NHP2YDL208W 471 nt3.5□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 ADK1YDR226W 669 nt3.5□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 NCE101YJL205C 162 nt3.5□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YBL108WYBL108W 306 nt3.5□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 PSK1YAL017W 4071 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 MDM1YML104C 3384 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 NPR3YHL023C 3441 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 snR65snR65 100 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 HYR1YIR037W 492 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YAR053WYAR053W 297 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 DRS2YAL026C 4068 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 NUP82YJL061W 2142 nt3.49□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 DOA4YDR069C 2781 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YCR022CYCR022C 345 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YDR102CYDR102C 333 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YER189WYER189W 369 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 RPL9BYNL067W 576 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 SSE1YPL106C 2082 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 SWT1YOR166C 1377 nt3.48□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 VAS1YGR094W 3315 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 PAU14YIL176C 363 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 MSL1YIR009W 336 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 PAU1YJL223C 363 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 EGD1YPL037C 474 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 MGR1YCL044C 1254 nt3.47□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 VPS52YDR484W 1926 nt3.46□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 TRM2YKR056W 1920 nt3.46□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 CHS2YBR038W 2892 nt3.46□□□□□ -1.85
GDE1Q02979 FRE2YKL220C 2136 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 TIM11YDR322C-A 291 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 DLS1YJL065C 504 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 TMA22YJR014W 597 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 YLR012CYLR012C 300 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 YLR458WYLR458W 381 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 YBL065WYBL065W 345 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 FLO1YAR050W 4614 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 DBP10YDL031W 2988 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 YSP2YDR326C 4317 nt3.46□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 RSN1YMR266W 2862 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 RPA190YOR341W 4995 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 YDL041WYDL041W 354 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 RPL39YJL189W 156 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 MBB1YJL199C 327 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 RPL8BYLL045C 771 nt3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q02979 APC9YLR102C 798 nt3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms