Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms