Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSF1Q00613 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSF1Q00613 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms