Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAMQ00059 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms