Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms