Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GNB1P62873 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms