Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms