Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LMO4P61968 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LMO4P61968 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LMO4P61968 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms