Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFRD-1P60508 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms