Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms