Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL23P55773 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL23P55773 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL23P55773 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL23P55773 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL23P55773 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL23P55773 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368.2 ms