Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCKAP1LP55160 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms