Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HADHBP55084 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHBP55084 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms