Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A2P55011 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms