Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPHB4P54760 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms