Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23BP54727 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms