Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACLYP53396 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACLYP53396 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACLYP53396 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACLYP53396 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACLYP53396 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms