Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP98P52948 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP98P52948 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP98P52948 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP98P52948 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP98P52948 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP98P52948 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP98P52948 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms