Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA4P52798 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms