Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK4P51957 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK4P51957 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK4P51957 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK4P51957 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK4P51957 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK4P51957 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms