Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SMARCA4P51532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA4P51532 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA4P51532 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms