Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRE11P49959 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRE11P49959 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms