Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPFP49454 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPFP49454 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPFP49454 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPFP49454 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms