Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPIAP49247 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPIAP49247 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPIAP49247 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPIAP49247 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPIAP49247 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPIAP49247 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPIAP49247 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms