Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NR4A2P43354 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms