Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms