Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms