Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYH11P35749 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYH11P35749 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYH11P35749 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYH11P35749 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYH11P35749 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms