Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLD1P28340 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLD1P28340 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLD1P28340 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLD1P28340 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLD1P28340 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLD1P28340 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms