Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms