Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB7P26010 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB7P26010 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB7P26010 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB7P26010 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB7P26010 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB7P26010 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms