Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA1P25391 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMA1P25391 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms