Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2AP24928 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms