Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA6P23229 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA6P23229 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms