Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1P21675 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1P21675 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1P21675 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms