Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASTP20810 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASTP20810 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASTP20810 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASTP20810 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASTP20810 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASTP20810 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASTP20810 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASTP20810 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASTP20810 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASTP20810 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms