Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP4AP20648 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms