Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD53P19397 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD53P19397 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD53P19397 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD53P19397 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD53P19397 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD53P19397 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD53P19397 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD53P19397 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD53P19397 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD53P19397 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD53P19397 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD53P19397 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms