Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms