Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB2P14652 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB2P14652 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms