Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms